L’any 1992 obri les portes el Museu Balear de Ciències Natural, situat a les cases de Can Prohom, a la carretera de Sóller al Port. És una institució de titularitat municipal gestionada conjuntament amb l’Associació Museu Balear de Ciències Naturals, una agrupació sense ànim de lucre.

El Museu és un centre de conservació i divulgació del patrimoni de les Balears. També es dedica a la investigació sobre la història natural de les Illes.

Entre les activitats cal destacar les visites guiades, els tallers, cursos, mostres, sessions informatives i congressos, jornades micològiques i excursions naturalistes. També compta a programes d’activitats educatives adreçades tant al professorat com als escolars.

El Museu compta amb diferents col·leccions, unes de titularitat municipal, altres propietat de l’Associació Museu Balear de Ciències Naturals, i dipòsits permanents. Destaca la col·lecció de Joan Bauzá de paleontologia rica en espècies fòssils especialitzada en els peixos i que compta amb biblioteca pròpia i molta documentació

La col·lecció Guillem Colom de micropaleontologia, una extensa biblioteca, col·leccions de revistes especialitzades, dibuixos i làmines originals.

La col·lecció Waldren compta amb restes fòssils de Myotragus balearicus i material que procedeix de les excavacions fetes per William Waldren a la cova de Muleta.

El Museu també té diverses línies obertes d’investigació i alguns dels estudis es fan en col·laboració amb institucions nacionals o internacionals.